Первые сведения о селе Лукино и построенном в нем деревянном храме Преображения Господня относятся к 1646 г. На реке Сетуни и ее притоке р. Переделке стояли две деревеньки, Лукино и Измалково...
В то время село являлось вотчиной ловчего царя Алексея Михайловича И. О. Леонтьева. В 1791 г. имение перешло во владение графини Варвары Петровны Разумовской, тщанием которой и был в 1819 г. построен дошедший с изменениями до нас каменный храм Преображения Господня, освященный в 1821 г.
В 1853 г. Лукино было куплено бароном Михаилом Львовичем Боде-Колычевым, историком, коллекционером и строителем.
В 1952 г.(ещё при жизни Сталина), по другим источникам в 1953 г.(после смерти Сталина) то, что уцелело от усадьбы и земля (чуть более 2 гектар), были предоставлены Русской Православной церкви под резиденцию Патриарха. В любом случае уже с 1951 г. Алексий I использовал эту усадьбу как резиденцию Патриарха де факто и правительство СССР просто узаконило существующее положение вещей.
Сейчас, при спонсорской поддержке МПС и «Газпрома» ведется реконструкция усадьбы Лукино: Научно-богословский центр, Церковно-приходская школа, часовня, крестильный храма в честь Иоанна Предтечи, братский корпус (жилое помещение для священников), патриарший парк, закрытая автостоянка, благотворительный дом для паломников и много другое).
Ныне здесь и находиться резиденция Патриарха Московского и всея Руси, Научно-богословский центр и общедоступный музей Русской Православной Церкви.