Наконец
VLC стал нормально показывать M2TS (MTS) файлы с AVCHD камеры под Linux.
MKV после ремукса M2TS тоже отлично показывает.
Работает по крайней мере в версии 0.9.4 (сейчас последняя 0.9.9).
Для декодирования h.264 использует кодек x264.
libavcodec так и научился понимать h.264 с PAFF interlacing (читай
тут).