Ковид в дикой природе
То, что у американских оленей обнаруживался и коронавирус в мазках, и антитела к коронавирусу САРС2- было известно еще с позапрошлого года. Весной 2021 года вышла статья про то, что коронавирус был обнаружен у 2 диких норок в Испании (то, что на пушных фермах идет заражение норок, было известно с весны 2020го).
В этом году обнаружили коронавирус и у диких канадских белохвостых оленей. Хотя и встречался он у них не в пример реже, чем у американских (около 1% из выборки), зато это был штамм "дельта", уже с некоторыми мутациями в шипиковом гене и белке ORF8.
В Индии, у погибшего молодого дикого леопарда была обнаружена системная коронавирусная инфекция (тоже дельта, с добавочными мутациями), с выраженными типичными гистологическими поражениями тканей и завирушенностью легких, мозга, лимфоузлов и селезенки.
У диких куньих (барсуки и куницы) из Франции, обнаружили серопозитивность к коронавирусу- примерно к у 16% выборки.
И анализ показывает, что коронавирусу сравнительно легко заражать скунсов, домовых мышей, лесных крыс, которые могут передавать его дальше. А разные штаммы могут помогать в этом направлении, тк слегка изменившиеся после мутаций шипики порой могут лучше связыватсья со звериными АСЕ2 (есть данные для грызунов, циветт, хорьков)
Моделирование взаимодействия вирусного шипика с АСЕ рецепторами животных разных видов показывает, что у коронавируса огромный потенциал для зооноза. Причем, заскочив в популяцию жвиотных, коронавирус обладает способностью быстро приспосабливаться (адаптационные мутации). Такого джинна побороть нелегко.
This zoonotic capacity model identified 540 species (out of 5400 total mammal species) within the 90th percentile probability (0.826 or higher, compared to a total of 2,401 mammal species with prediction scores above 0.5; see Supplementary File 1 for predictions on all 5,400 species, https://doi.org/10.25390/caryinstitute.c.5293339). The top 10% of species with the highest predicted probabilities includes representatives from 13 orders. Most primates were predicted to have high zoonotic capacity and collectively showed stronger viral binding compared to other mammal groups. Additional orders with numerous species predicted to have high zoonotic capacity (at least 75% of species above 0.5) include Hyracoidea (hyraxes), Perissodactyla (odd-toed ungulates), Scandentia (treeshrews), Pilosa (sloths and anteaters), Pholidota (pangolins), and non-cetacean Artiodactyla (even-toed ungulates).
The rapidity of in vitro and in vivo SARS-CoV-2 selection reveals residues with functional significance during host-switching, illustrating the potential for spillback reservoir hosts to accelerate evolution, and demonstrating plasticity of viral adaptation in animal models.
В этом году обнаружили коронавирус и у диких канадских белохвостых оленей. Хотя и встречался он у них не в пример реже, чем у американских (около 1% из выборки), зато это был штамм "дельта", уже с некоторыми мутациями в шипиковом гене и белке ORF8.
В Индии, у погибшего молодого дикого леопарда была обнаружена системная коронавирусная инфекция (тоже дельта, с добавочными мутациями), с выраженными типичными гистологическими поражениями тканей и завирушенностью легких, мозга, лимфоузлов и селезенки.
У диких куньих (барсуки и куницы) из Франции, обнаружили серопозитивность к коронавирусу- примерно к у 16% выборки.
И анализ показывает, что коронавирусу сравнительно легко заражать скунсов, домовых мышей, лесных крыс, которые могут передавать его дальше. А разные штаммы могут помогать в этом направлении, тк слегка изменившиеся после мутаций шипики порой могут лучше связыватсья со звериными АСЕ2 (есть данные для грызунов, циветт, хорьков)
Моделирование взаимодействия вирусного шипика с АСЕ рецепторами животных разных видов показывает, что у коронавируса огромный потенциал для зооноза. Причем, заскочив в популяцию жвиотных, коронавирус обладает способностью быстро приспосабливаться (адаптационные мутации). Такого джинна побороть нелегко.
This zoonotic capacity model identified 540 species (out of 5400 total mammal species) within the 90th percentile probability (0.826 or higher, compared to a total of 2,401 mammal species with prediction scores above 0.5; see Supplementary File 1 for predictions on all 5,400 species, https://doi.org/10.25390/caryinstitute.c.5293339). The top 10% of species with the highest predicted probabilities includes representatives from 13 orders. Most primates were predicted to have high zoonotic capacity and collectively showed stronger viral binding compared to other mammal groups. Additional orders with numerous species predicted to have high zoonotic capacity (at least 75% of species above 0.5) include Hyracoidea (hyraxes), Perissodactyla (odd-toed ungulates), Scandentia (treeshrews), Pilosa (sloths and anteaters), Pholidota (pangolins), and non-cetacean Artiodactyla (even-toed ungulates).
The rapidity of in vitro and in vivo SARS-CoV-2 selection reveals residues with functional significance during host-switching, illustrating the potential for spillback reservoir hosts to accelerate evolution, and demonstrating plasticity of viral adaptation in animal models.