дыбр рабочий
Честно проишачил до утра за ноутом, вместо привычного тупления в бесконечное познание.
Собрал-таки из кусков trnL-F для образца из Нрнадзора, с ним не надо больше трахаться, ура, удалось обойти чортовы шпильки и получить что-то очень похожее на честную прямую последовательность для двух образцов.
rbcL у нас очень короткий, это rbcL-а, на этом куске два образца вообще идентичны 100% (в trnL-F есть одна замена), начинаю париться, что надо доставить вторую половину, чтобы было длинно как у всех, но лучшее - враг хоть какого-нибудь, надо срочно застолбить эту маленькую полянку.
И неприятный сюрприз - сиквенс matK для нрнадзорского образца оказался калом дристным. Не может быть в пределах вида в хп-маркёре СТОЛЬКО замен, сравнил оба с мускарём - нет, стопроцентно слабый сигнал и грязь. Причём сиквенс на первый взгляд не выглядит дико грязным, trnL, засранный побочными продуктами со шпилек, на вид намного грязнее, а вот же. Вот что значит поваленная ДНК из спиртовой фиксации.
Попробую переставить и очень тщательно почистить, через гель и колонки..
Впереди ещё головоломное и требующее большой собранности - довынуть последовательности из Генбанка и слепить их в ровненький кирпич-конкатенат. С непривычки на это должно уйти немало времени: сейчас канделябры бакалавры такое на дипломы делают, а я вот сам себе студент и научрук.
Собрал-таки из кусков trnL-F для образца из Нрнадзора, с ним не надо больше трахаться, ура, удалось обойти чортовы шпильки и получить что-то очень похожее на честную прямую последовательность для двух образцов.
rbcL у нас очень короткий, это rbcL-а, на этом куске два образца вообще идентичны 100% (в trnL-F есть одна замена), начинаю париться, что надо доставить вторую половину, чтобы было длинно как у всех, но лучшее - враг хоть какого-нибудь, надо срочно застолбить эту маленькую полянку.
И неприятный сюрприз - сиквенс matK для нрнадзорского образца оказался калом дристным. Не может быть в пределах вида в хп-маркёре СТОЛЬКО замен, сравнил оба с мускарём - нет, стопроцентно слабый сигнал и грязь. Причём сиквенс на первый взгляд не выглядит дико грязным, trnL, засранный побочными продуктами со шпилек, на вид намного грязнее, а вот же. Вот что значит поваленная ДНК из спиртовой фиксации.
Попробую переставить и очень тщательно почистить, через гель и колонки..
Впереди ещё головоломное и требующее большой собранности - довынуть последовательности из Генбанка и слепить их в ровненький кирпич-конкатенат. С непривычки на это должно уйти немало времени: сейчас канделябры бакалавры такое на дипломы делают, а я вот сам себе студент и научрук.