Ген, связанный с длительным C0 19, обнаружен в анализе тысяч пациентов
Частицы SC0V-2 (зеленый), вируса, вызывающего C0 19, на инфицированной клетке почки (красный). Предоставлено: Стив Гшмайсснер/Science Photo Library
Первая полногеномная охота по поиску генетических факторов риска длительного C0 19 дала результат: последовательность ДНК рядом с геном FOXP4 , который активен в легких и некоторых иммунных клетках.
В исследовании, которое было выпущено в виде препринта 1 июля , использовались данные, собранные у 6450 человек с длительным течением COVID в 16 странах. Исследователи надеются, что этот анализ будет только началом: требуется огромное количество данных, чтобы выявить такое сложное заболевание, как COVID, которое связано с более чем 200 симптомами, включая сильную усталость, нервную боль и трудности с концентрацией внимания и памятью.
Длительное лечение COVID: почему мир все еще ждет
«Очень важно, чтобы такие исследования проводились», - говорит Крис Понтинг, изучающий медицинскую биоинформатику в Эдинбургском университете, Великобритания. «Он будет набирать обороты и увеличивать силу по мере увеличения числа дел».
Такие исследования являются первыми шагами к тому, чтобы больше узнать о причинах длительного COVID, говорит Стефани Лонге, иммунолог из Университета Жана Моне в Сент-Этьене, Франция, у которой длительный COVID. «Есть несколько ключевых тем, которые важны для пациентов, включая лечение и профилактику», - говорит она. «Когда причины, возможно, многофакторные, [будут] ясно поняты, это поможет лечить пациентов, которые будут более восприимчивы к развитию затяжного COVID, и потенциально предотвратить затяжной COVID».
Гены восприимчивости
Глобальная инициатива по генетике хозяев COVID-19 более трех лет занимается поиском последовательностей ДНК, связанных с риском развития тяжелой формы COVID-19. Эта охота, которая продолжается, задействовала гены, участвующие в иммунной системе и позволяющие вирусу SARS-CoV-2 проникать в клетки 2 .
По словам Хьюго Зеберга, генетика из Каролинского института в Стокгольме и ведущего автора препринта, длительное исследование COVID является побочным продуктом этих усилий. Чтобы изучить состояние, команда собрала данные 24 исследований, в которых приняли участие в общей сложности почти 6500 человек с диагнозом длительный COVID, а также более миллиона других участников, которые служили контролем.
Насколько распространен длительный COVID? Почему исследования дают разные ответы
В одном анализе, который объединил данные 11 из этих исследований, исследователи обнаружили конкретную область генома, которая была связана с примерно в 1,6 раза более высокой вероятностью развития затяжного COVID. Этот сегмент ДНК находится рядом с геном FOXP4 , который активен в легких и других органах. Вариант, связанный с длительным COVID, также связан с более высокой экспрессией FOXP4 в клетках легких.
Предыдущие исследования связывали тот же ген с повышенным риском тяжелого течения COVID-19, а Зеберг и его коллеги обнаружили, что он также связан с раком легких. Хотя наличие тяжелого COVID-19 увеличивает риск развития длительного COVID, команда обнаружила, что вклад варианта ДНК в риск длительного COVID был слишком велик, чтобы его можно было объяснить только его связью с тяжелым течением COVID-19. «Этот вариант оказывает гораздо более сильное влияние на длительный COVID, чем его влияние на тяжесть», - говорит Зеберг.
Повторение этого открытия в других наборах данных помогло бы укрепить выводы исследования, говорит Чжуншань Ченг, биоинформатик из Детской исследовательской больницы Святого Иуды в Мемфисе, штат Теннесси. Он отмечает , что большая часть данных, использованных в длительном анализе COVID, также использовалась в анализе, который обнаружил связь между FOX4P и тяжелым течением COVID-19. Свежие данные помогут исключить возможность того, что другие факторы, такие как рак легких, могли повлиять на очевидную связь с FOX4P .
Еще не все
Тем не менее, это исследование является прорывом, говорит Ченг, и будущие исследования, вероятно, добавят список генетических факторов риска для длительного COVID.
«Это будет не просто один ответ, это будет целый ряд уязвимостей людей, которые влияют на то, почему они не вылечились от COVID», - говорит Понтинг. Он и его коллеги предложили провести исследование, которое включало бы ДНК 15 000 человек с длительным течением COVID. Но рецензенты гранта отклонили это предложение, говорит он, потому что посчитали состояние слишком сложным, чтобы его можно было анализировать так, как предложила команда Понтинга.
«Я не согласен, - говорит он. «Это очень сложно, но очень важно разобраться. Медицинские и социально-экономические издержки длительного COVID огромны».
Дои: https://doi.org/10.1038/d41586-023-02269-2