Комментарий Upright Biped насчет системы трансляции кода: что будет, если заменить кодон?
REC, ты в самом деле спрашиваешь, что будет, если мы изменим один кодон на другой: будет ли представлена для связывания другая аминокислота?! В самом деле?
Такое впечатление, что ты думаешь, что этот вопрос - неубиенная карта против ID, что он вскрывает что-то важное для понимания того, как и почему существуют определенные отношения между кодонами и аминокислотами в живой клетке. Я вот тут сижу и читаю твои глубокомысленные вопросы: “Давайте, мол, переставим нуклеотиды в Trp кодоне. Приведет ли это к тому, что в первичную структуру белка будет вставлена другая аминокислота?” -и- “Если я поставлю нуклеотиды ‘AUG’, кодирующие метионин, в другом порядке, вставится ли другая аминокислота в белок? Да или нет.” … Я так понимаю, что смысл того, что ты спрашиваешь, сводится к вопросу, изменится ли физический эффект при замене кодона.
Ну и ну...
Rec, представление определенной аминокислоты для связывания в определенный момент времени - это эффект трансляции. Помни об этом: временной эффект, вызываемый посредством трансляции носителя кода. Трансляция требует наличия одной конфигурации материи для того, чтобы инициировать эффект, и другой конфигурации материи для того, чтобы физически задать, каким именно этот эффект должен быть. Существуют вполне определенные физические причины для того, чтобы это было именно так, не самой последней из которых является наличие неумолимых законов природы. И, как и в любом другом известном науке примере трансляции информации, роль реляционной архитектуры, осуществляющей трансляцию, заключается в том, чтобы обеспечивалась разрывность (физико-химическая независимость) между конфигурацией носителя и эффектом трансляции в рамках единой системы. Не вроде бы, не как бы, а именно так! С точки зрения строгой физики, здесь всё происходит абсолютно так же, как и в любой другой системе трансляции, которые когда-либо наблюдались. Это научный факт, результат строгих научных наблюдений, за которыми стоит разработанная теория вопроса и экспериментальное её подтверждение, чему мы обязаны самым замечательным умам, работавшим в этой области за последние 100 лет. Эти факты никуда не денутся оттого, что они кому-то не нравятся, что кому-то хочется представить всё так, что система трансляции сводима к физическим свойствам своих компонентов. Несводима. Свыкнись с этой мыслью. Трансляция - эффект организации, а не динамики. И, откровенно говоря, эти наблюдения - только верхушка айсберга, только часть тех научных наблюдений, которые проясняют, как работает система трансляции генетического кода. Их очень много. Может быть, вместо того, чтобы бездумно повторять беззубые возражения типа “это всё только химия, ребята”, тебе стоит спросить себя, почему так получилось, что когда тебя учили, как работает клеточный трансляционный аппарат, тебе не объяснили для начала, что такое трансляция.
Конечно, мы все знаем, чем тут дело пахнет - тем, что ID пришелся не ко двору в биологическом истеблишменте.
REC, are you actually asking if we change the codon to a different codon, will we get a different amino acid presented for binding?
Really? You present it as if it’s some deep challenge that your ID opponents should be wary of - like it demonstrates something of significance about how and why codon/amino acid relationships are established in the cell.
I’m sitting here reading these questions from you: “Lets re-arrange a Trp codon. Does the amino acid incorporated change?” -and- “ If I rearrange the nucleotide bases ‘AUG’ that code for methionine, does the amino acid incorporated change? Yes or no.” … and I’ll be darned if I can make anything out of it other than you are actually asking if we change the codon, does the effect change.
Good grief.
Rec, having a certain amino acid presented for binding at a certain point in time is a translated effect. Keep that in mind - a temporal effect brought into being under the control of a translated representational medium. It requires one arrangement of matter to evoke the effect, and another arrangement of matter to physically establish what the effect will be. There are very specific physical reasons for this to be the case - not the least of which is the presence of inexorable law. And like every other translated effect ever known to exist, it’s a relational architecture that must preserve the discontinuity between the arrangement of the medium and its effect within its system. It’s not sort-of like it, it’s not kinda like it; from a strict physics perspective, it’s exactly like every other translated effect ever observed. These are demonstrable facts that stem from observation, theory, and experimental confirmation by some of the brightest minds of the past 100 years - and these facts are not going away just because of someone’s ideological preference to imagine the system as a local entity that’s reducible to its physical properties. It isn’t. Get over it. Translation stems from contingent organization, not dynamics. And frankly, this is only the tip of the observations that clarify the genetic translation system. There’s plenty more. Perhaps instead of wasting your own time by regurgitating toothless counter-observations (like “it’s just chemistry folks”) maybe you should wonder why you were taught the genetic translation apparatus without being given a core understanding of what translation is to begin with.
Of course, we all know the deal here - the zero tolerance policy regarding ID.
Do what you gotta do. As for myself, I am off to spend a long weekend with my toes in the surf, sipping a Tecate with my wife, listening to some Ska.
cheers