Китай хотел "затушевать" потенциальный источник пандемии Covid-19?
Китай удалил ранние данные о коронавирусе, которые могли бы помочь объяснить происхождение пандемии, считают исследователи
Ученые говорят, что полученные данные являются "prima facie" доказательством того, что Китай хотел "затушевать" потенциальный источник пандемии Covid-19
Дженнифер Ригби
23 июня 2021 - 15:33
Детективная работа ведущего американского ученого показала, что ранние последовательности генома коронавируса были удалены из ключевой глобальной базы данных по просьбе китайских исследователей.
Последовательности, которые были восстановлены из облачного хранилища и опубликованы в препринте, были названы экспертами "самыми важными данными" о происхождении Covid-19 более чем за год.
Появление последовательностей также указывает на то, что Китай располагает большим количеством данных, относящихся к раннему периоду эпидемии, которые могут быть восстановлены исследователями.
Статья была опубликована на сервере препринтов bioRxiv профессором Джесси Блумом, экспертом по вирусам гриппа из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле, США.
Исследуя Sars-CoV-2, профессор Блум обнаружил проект Уханьского университета, в рамках которого было секвенировано 34 положительных случая коронавируса в январе 2020 года и еще 16 случаев в начале февраля.
В проекте рассматривалась возможность диагностики инфекции Sars-Cov-2 с помощью метода, называемого нанопоровым секвенированием. Его результаты, опубликованные в марте в виде препринта, а затем в июне после экспертной оценки, остаются в открытом доступе.
Однако геномные последовательности, полученные в ходе исследования, которые были загружены в американский архив Sequence Read Archive (SRA), входящий в состав Национальных институтов здравоохранения (NIH), недоступны.
Эти последовательности - карты того, как устроены вирусы, - крайне важны для ученых, изучающих изменения вирусного генома с течением времени.
Однако при поиске этого проекта в SRA - в другой литературе он упоминается под номером PRJNA612766 - профессор Блум обнаружил сообщения о том, что он был удален. Эта процедура происходит только в том случае, если сотрудники SRA просят убрать данные.
В NIH сообщили The Telegraph, что в июне 2020 года они "рассмотрели просьбу подавшего запрос исследователя об изъятии данных" и удалили их.
"Податель запроса указал, что информация о последовательности была обновлена, была представлена в другую базу данных, и он хотел удалить данные из SRA, чтобы избежать проблем с контролем версий", - сказал представитель организации. "Подавшие заявку исследователи обладают правами на свои данные и могут потребовать их изъятия".
The Telegraph обратилась к авторам статьи за комментариями, но на момент публикации они не ответили. Они также не ответили профессору Блуму.
Однако профессор Блум нашел большую часть удаленных геномных данных через поиск в облаках Google и Amazon, используемых для хранения SRA.
Удаленные данные могут помочь заполнить недостающее звено для ученых, озадаченных эволюцией Sars-CoV-2 у людей.
Независимо от того, как он в конечном итоге попал к людям, эксперты сходятся во мнении, что Sars-CoV-2 произошел от летучих мышей. Но до сих пор самые ранние известные образцы из Уханя - включая образцы, взятые на рынке морепродуктов Хуанань, который первоначально подозревался как потенциальный источник вспышки - были генетически более далеки от этих вирусов, чем другие образцы Sars-CoV-2, полученные в других частях Китая и даже в других частях мира.
Удаленные последовательности заполняют этот пробел, поскольку они ближе к коронавирусам летучих мышей, и поэтому могут представлять собой более ранний этап эволюции вируса. Они служат дополнительным доказательством того, что вирус циркулировал среди людей в Ухане уже осенью 2019 года.
Эксперты заявили, что это важное событие.
Профессор Расмус Нейлсен, эксперт по геномике из Калифорнийского университета в Беркли, написал в Твиттере: "Это самые важные данные, которые мы получили относительно происхождения Covid-19 более чем за год".
Однако есть и другие важные последствия, как объяснил профессор Блум в длинной ветке Твиттера.
"Во-первых, факт, что этот набор данных был удален, должен заставить нас скептически относиться к тому, что все другие соответствующие ранние последовательности Уханя были переданы", - сказал он, указав, что Китай приказал многим лабораториям уничтожить ранние образцы.
Китайские ученые также получили приказ проверить и централизованно утвердить свои публикации по коронавирусам - приказ, который поступил за день до публикации препринта, связанного с удаленными образцами.
Ученые говорят, что полученные данные являются "prima facie" доказательством того, что Китай хотел "затушевать" потенциальный источник пандемии Covid-19
Дженнифер Ригби
23 июня 2021 - 15:33
Детективная работа ведущего американского ученого показала, что ранние последовательности генома коронавируса были удалены из ключевой глобальной базы данных по просьбе китайских исследователей.
Последовательности, которые были восстановлены из облачного хранилища и опубликованы в препринте, были названы экспертами "самыми важными данными" о происхождении Covid-19 более чем за год.
Появление последовательностей также указывает на то, что Китай располагает большим количеством данных, относящихся к раннему периоду эпидемии, которые могут быть восстановлены исследователями.
Статья была опубликована на сервере препринтов bioRxiv профессором Джесси Блумом, экспертом по вирусам гриппа из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле, США.
Исследуя Sars-CoV-2, профессор Блум обнаружил проект Уханьского университета, в рамках которого было секвенировано 34 положительных случая коронавируса в январе 2020 года и еще 16 случаев в начале февраля.
В проекте рассматривалась возможность диагностики инфекции Sars-Cov-2 с помощью метода, называемого нанопоровым секвенированием. Его результаты, опубликованные в марте в виде препринта, а затем в июне после экспертной оценки, остаются в открытом доступе.
Однако геномные последовательности, полученные в ходе исследования, которые были загружены в американский архив Sequence Read Archive (SRA), входящий в состав Национальных институтов здравоохранения (NIH), недоступны.
Эти последовательности - карты того, как устроены вирусы, - крайне важны для ученых, изучающих изменения вирусного генома с течением времени.
Однако при поиске этого проекта в SRA - в другой литературе он упоминается под номером PRJNA612766 - профессор Блум обнаружил сообщения о том, что он был удален. Эта процедура происходит только в том случае, если сотрудники SRA просят убрать данные.
В NIH сообщили The Telegraph, что в июне 2020 года они "рассмотрели просьбу подавшего запрос исследователя об изъятии данных" и удалили их.
"Податель запроса указал, что информация о последовательности была обновлена, была представлена в другую базу данных, и он хотел удалить данные из SRA, чтобы избежать проблем с контролем версий", - сказал представитель организации. "Подавшие заявку исследователи обладают правами на свои данные и могут потребовать их изъятия".
The Telegraph обратилась к авторам статьи за комментариями, но на момент публикации они не ответили. Они также не ответили профессору Блуму.
Однако профессор Блум нашел большую часть удаленных геномных данных через поиск в облаках Google и Amazon, используемых для хранения SRA.
Удаленные данные могут помочь заполнить недостающее звено для ученых, озадаченных эволюцией Sars-CoV-2 у людей.
Независимо от того, как он в конечном итоге попал к людям, эксперты сходятся во мнении, что Sars-CoV-2 произошел от летучих мышей. Но до сих пор самые ранние известные образцы из Уханя - включая образцы, взятые на рынке морепродуктов Хуанань, который первоначально подозревался как потенциальный источник вспышки - были генетически более далеки от этих вирусов, чем другие образцы Sars-CoV-2, полученные в других частях Китая и даже в других частях мира.
Удаленные последовательности заполняют этот пробел, поскольку они ближе к коронавирусам летучих мышей, и поэтому могут представлять собой более ранний этап эволюции вируса. Они служат дополнительным доказательством того, что вирус циркулировал среди людей в Ухане уже осенью 2019 года.
Эксперты заявили, что это важное событие.
Профессор Расмус Нейлсен, эксперт по геномике из Калифорнийского университета в Беркли, написал в Твиттере: "Это самые важные данные, которые мы получили относительно происхождения Covid-19 более чем за год".
Однако есть и другие важные последствия, как объяснил профессор Блум в длинной ветке Твиттера.
"Во-первых, факт, что этот набор данных был удален, должен заставить нас скептически относиться к тому, что все другие соответствующие ранние последовательности Уханя были переданы", - сказал он, указав, что Китай приказал многим лабораториям уничтожить ранние образцы.
Китайские ученые также получили приказ проверить и централизованно утвердить свои публикации по коронавирусам - приказ, который поступил за день до публикации препринта, связанного с удаленными образцами.