ФЛАКОН. бутылочка, пузырек небольших размеров, преимущественно для духов. Традиционно считается заимствованием из французского.
Ну, что тут сказать: скорее всего именно в такой форме в современный русский язык слово и пришло из французского, но, корень в этом слове славянский. Корень, приставка и суффикс. ВЛАГА. Из корня ЛАГ-ЛОЖ. ФЛАКОН для ВЛОЖеНия в него ВЛАГИ.