Эволюционно-генетический вопрос
Он возник у моего френда.
Оригинал взят у olegvm в Что я никак не могу понять
Как сообщения о том, что все неафриканцы имеют неандертальские гены, совмещается с концепциями «евразийского Адама» и «митохондриальной Евы»?
Оригинал взят у olegvm в Что я никак не могу понять
Как сообщения о том, что все неафриканцы имеют неандертальские гены, совмещается с концепциями «евразийского Адама» и «митохондриальной Евы»?
"Откуда берутся митохондриальные Евы
Любая популяция любого вида животных обязательно имела в прошлом свою митохондриальную Еву - последнюю общую праматерь всех ныне живущих представителей данной популяции по прямой материнской линии. Евы появляются автоматически и неизбежно из-за случайных колебаний частот генетических вариантов (например, вариантов митохондриальной ДНК) в популяции. Чтобы понять, почему так получается, рассмотрим простую модель. Допустим, у нас есть популяция, включающая десять самок, у каждой из которых имеется свой вариант мтДНК, немного отличающийся от остальных. Число самок (то есть размер популяции) не имеет принципиального значения: оно влияет только на среднее число поколений, требующихся для того, чтобы одна из этих самок стала Евой. Чем больше популяция, тем дольше придется ждать.
Предположим, что каждая самка оставляет после себя с равной вероятностью либо ноль дочерей, либо одну, либо две. Обозначим исходные варианты мтДНК у наших десяти самок буквами латинского алфавита:
abcdefghij (1)
Это поколение 1. Чтобы смоделировать следующее (второе) поколение, воспользуемся генератором случайных чисел. Сойдет и обычная игральная кость. Нам нужна последовательность из десяти случайных целых чисел в диапазоне от нуля до двух, чтобы определить, сколько дочерей родила каждая самка. Бросаем кость десять раз, если выпадает один или два, записываем ноль, если три или четыре - записываем единицу, если пять или шесть - двойку. У меня получилась такая последовательность:
2212210011
В соответствии с этими числами "родим" для каждой самки дочерей. Учитывая, что дочь наследует мтДНК матери, выпишем распределение митохондриальных гаплотипов (вариантов) в поколении 2:
aabbcddeefij (2)
Можно заметить, что из десяти исходных гаплотипов во второе поколение перешли только восемь. Две самки (g и h) не оставили дочерей, и их митохондриальные линии пресеклись. Самок у нас теперь стало 12, поэтому для того, чтобы смоделировать поколение 3, понадобится 12 случайных чисел. Вот они:
220020212021
А вот и третье поколение:
aaaaccddeeeiij (3)
В третьем поколении "потерялись" еще два гаплотипа: b и f. Продолжая моделирование, получаем последовательность поколений:
aaaeeejj (4)
eeejj (5)
ejjjj (6)
eejjjjjj (7)
eeejjj (8)
eeejj (9)
eeeej (10)
eeeejj (11)
eeeeeej (12)
eeeejj (13)
eeeej (14)
eeeej (15)
eeeej (16)
eeeeee (17)
Вот и все: к семнадцатому поколению в нашей популяции остался только один митохондриальный гаплотип из десяти исходных. Это значит, что прямые потомки по женской линии остались только у одной из исходных десяти самок.
Процесс этот абсолютно неизбежен: сколько бы мы ни взяли исходных самок с разными гаплотипами, через какое-то число поколений в популяции останется только один из них. При этом одна из древних носительниц этого гаплотипа автоматически превращается в митохондриальную Еву - последнюю общую праматерь всех особей в популяции по непрерывной женской линии.
Кстати, какая именно самка в нашей модели стала Евой для поколения № 17? Думаете, это самка "е" из поколения 1? А вот и нет: у поколения 17 есть и более поздняя общая праматерь. Это самка с гаплотипом "е" из поколения 6. Самка "е" из поколения 1, конечно, тоже является общей праматерью поколения 17 по женской линии, но она не самая поздняя из таких праматерей.
Reply
Что будет, если популяция разделится на две - например, часть особей переселится на другой материк, и каждая из двух дочерних популяций будет процветать на своем материке? В этом случае в каждой из двух популяций тоже обязательно рано или поздно закрепится какой-то один из исходного набора гаплотипов. Причем, скорее всего, на разных материках это будут разные гаплотипы. Получится, что у каждой из двух популяций есть своя митохондриальная Ева. Кроме того, будет и третья Ева - общая для обеих групп. Она окажется глубже в прошлом, чем обе "персональные" Евы разделившихся популяций."
Reply
Ну Ева-их-всех все равно была, иначе откуда взялась гомология между ихними молекулами мт? :)
Сейчас Вы описываете ситуацию быстрого роста популяции, когда топология филогенетического древа приближается к "звездной" - т.е. сильно сбалансированной. Это вполне реальная схема, большинство кластеров которые возникли в период неолита таковы.
Reply
Reply
Reply
1. вырезать из генеалогии все вершины степени 2
2. отношение длин любых двух путей от корня до листика зажато в константных границах
Reply
Reply
В приведенном модельном эксперименте изначально заданы 10 различных вариантов, с ходом эксперимента многообразие уменьшается вплоть до полного вытеснения остальных вариантов одним. Правильно ли я понимаю, что рассмотренный вероятностный процесс ведет всегда к уменьшению разнообразия? В реальности уменьшению разнообразия противостоят мутации?
Reply
Leave a comment