Чисто по работе (совсем, то есть)
В лекции Науменко по NGS приводятся вредные советы, как запланировать работу, чтобы максимально отдалить результат:
- Получите идеальную сборку;- Напишите свой ассемблер;
- Займитесь большими геномами (>200MB);- Займитесь диплоидным, тетраплоидным геномом с большой гетерозиготностью;
- Займитесь видом, для которого трудно выделить ДНК - получается геномная смесь из него, его пищи, его паразитов и соседей.
И вот это может быть очень смешно, но к настоящему моменту мы совершили четыре ошибки из вышеперечисленных пяти.
То, что начинали в 2011, когда послушать про это было негде, как-то не очень утешает.
Особенно не утешает, что не все коллабораторы готовы учиться на ошибках. Тем более, на чужих.
- Получите идеальную сборку;- Напишите свой ассемблер;
- Займитесь большими геномами (>200MB);- Займитесь диплоидным, тетраплоидным геномом с большой гетерозиготностью;
- Займитесь видом, для которого трудно выделить ДНК - получается геномная смесь из него, его пищи, его паразитов и соседей.
И вот это может быть очень смешно, но к настоящему моменту мы совершили четыре ошибки из вышеперечисленных пяти.
То, что начинали в 2011, когда послушать про это было негде, как-то не очень утешает.
Особенно не утешает, что не все коллабораторы готовы учиться на ошибках. Тем более, на чужих.