Global Times: Все 457 образцов животных с рынка Хуанань дали отрицательный результат на COVID-19
Китайские ученые, работающие над поиском источников COVID-19, обсуждают последние результаты, решают проблему прозрачности данных
Автор: Лю Цайю
Примечание редактора: На фоне волн жаркой дискуссии о происхождении COVID-19 в международном сообществе и недавней публикации Китаем нового анализа, собранного на рынке морепродуктов Хуанань в Ухане, репортеры Global Times в пятницу взяли интервью у Лю Цзюня, исследователя из CDC Китая, который также является членом совместной группы экспертов ВОЗ-Китай, и Цянь Чжаохуэй из Института биологии патогенов Китайской академии медицинских наук, об их последних выводах и обсуждениях связано с отслеживанием происхождения COVID-19.
GT: В сообщениях иностранных СМИ утверждалось, что ваша команда удалила данные, загруженные на GISAID в процессе представления документа об анализе данных, собранных на рынке морепродуктов Хуанань, это правда?
Лю: Мы представили первый проект статьи в журнал Nature в феврале 2022 года, и в процессе представления и доработки наши команды загрузили исходные данные, относящиеся к статье, на платформу обмена данными GISAID (GISAID) в соответствии с международной практикой публикации научных статей. Загруженные данные использовались только для обзора журнала и доступа, и было согласовано с Nature и GISAID, что данные будут опубликованы публично после официальной публикации статьи. Данные и ссылка для доступа всегда были там и не были удалены.
11 марта 2023 года мы обнаружили, что данные, загруженные на платформу GISAID, были преждевременно опубликованы сотрудниками GISAID до публикации статьи и без ведома нашей команды. Узнав об этом, сотрудники нашей команды позвонили на платформу GISAID, чтобы подтвердить ситуацию. Нам сказали, что публикация была ошибкой сотрудников GISAID. После этого платформа отключила функцию обмена данными, но данные остались на платформе. Ни наша команда, ни платформа не удалили данные, и ссылки на доступ к данным для обзора журнала всегда были там.
Последняя версия нашей статьи была опубликована онлайн в Nature 5 апреля, и все исходные данные были опубликованы одновременно в четырех международных и внутренних базах данных.
GT: каковы основные выводы статьи? Были ли какие-либо новые открытия или контент, которые способствуют выявлению происхождения вируса?
Лю: Секвенирование нуклеиновых кислот и генов 1380 образцов окружающей среды и замороженных животных, собранных на рынке Хуанань с января по март 2020 года, показало, что все 457 образцов животных, собранных на рынке, дали отрицательный результат на COVID-19. И 73 из 923 проб окружающей среды оказались положительными на COVID-19, при этом были выделены три штамма вируса. Результаты секвенирования показали, что геном на 99,9-100 процентов гомологичен геному ранних случаев, что позволяет предположить, что эти штаммы вируса были получены от пациентов, инфицированных COVID-19.
Секвенирование генов образцов окружающей среды показало обилие фрагментов секвенирования генов человека, а также фрагментов из обычных продуктов холодильной цепи, таких как свиньи, коровы, куры и утки, продаваемых на рынке, а также небольшое количество фрагментов генов животных, таких как мыши и кошки. Это еще раз указывает на то, что присутствие COVID-19 на рынке, скорее всего, было получено от ранних пациентов. Рынок Хуанань был всего лишь местом вспышки, а не источником. Данные также подтверждают отчет об отслеживании происхождения, подготовленный совместно группой экспертов ВОЗ и Китая.
GT: Основываясь на данных, которые ваша команда загрузила в GISAID, некоторые международные эксперты пришли к другому выводу. Как вы думаете, различия связаны с различными методами анализа или по другим причинам?
Лю: Мы не можем исключить возможность того, что различные методы анализа, программное обеспечение и параметры могут привести к разным результатам, но штрих-кодирование ДНК показало наибольшее количество человеческих генов среди образцов окружающей среды, что указывает на то, что загрязнение на рынке, скорее всего, от ранних пациентов. Штрих-кодирование ДНК также показало наличие множества животных, включая свиней, коров, кур и уток на рынке до его закрытия.
Некоторые эксперты обеспокоены наличием в образцах предполагаемых генов животных, чувствительных к COVID-19. Однако существующие данные исследований не подтверждают, что животные на рынке были заражены COVID-19. Даже если животные были инфицированы, нельзя исключать, что передача от человека животному произошла после заражения людей. Поскольку время отбора проб было в январе 2020 года, позже, чем время, когда были зарегистрированы случаи COVID-19, мы считаем, что вирус, вероятно, попал на рынок через инфекции человека или продукты холодовой цепи, и научной основы для так называемой передачи от животного к человеку на рынке явно недостаточно.
GT: В некоторых сообщениях СМИ говорилось, что данными, загруженными на GISAID, следовало поделиться раньше. Почему группа экспертов не поделилась этими данными раньше и ожидают ли их еще какие-либо публикации?
Лю: После вспышки COVID-19 китайские ученые проводят большую работу открытым, прозрачным и ответственным образом, чтобы проследить происхождение COVID-19 и своевременно делиться ими. Например, на ранних стадиях вспышки полная последовательность генома коронавируса была загружена на платформу базы данных GISAID, а эпидемиологические расследования ранних случаев были также опубликованы в медицинском журнале Новой Англии (NEJM).
В начале 2020 года эксперты из CDC Китая собрали с рынка образцы окружающей среды и животных, которые показали, что все образцы животных дали отрицательный результат, а 73 образца окружающей среды были положительными. Секвенирование генов вируса показало, что они в значительной степени гомологичны генам ранних случаев. Результаты показали, что вирус существовал в окружающей среде в результате заражения ранних случаев, а рынок был очагом вспышки на ранних стадиях распространения вируса.
Все данные, которыми мы располагали на тот момент, были представлены совместной группе экспертов ВОЗ по отслеживанию происхождения в период с июля 2020 по январь 2021 года, и они были полностью обсуждены экспертами.
Группа экспертов также посетила рынок в январе 2021 года. Они признали надежность и важность методов отбора проб и тестирования, а также данных и результатов и включили результаты в отчет ВОЗ о фазе I по отслеживанию происхождения.
В отчете предлагается провести дополнительные расследования, включая штрих-кодирование ДНК образцов с рынка Хуанань. Основываясь на предложениях, китайские эксперты провели соответствующее исследование, которое показало, что штрих-кодирование ДНК не дало никаких новых прямых доказательств в отношении отслеживания происхождения и доказало, что предыдущий вывод совместного отчета ВОЗ и Китая по отслеживанию происхождения был научным и объективным.
В феврале 2022 года эксперты CDC Китая представили данные Huanan market в Nature для экспертной оценки, в то время как они также были опубликованы через международную платформу препринтов и загружены в GISAID в соответствии с международной практикой. В настоящее время соответствующие данные были опубликованы в четырех базах данных в стране и за рубежом, и статья была официально опубликована в Nature.
После совместного отчета фазы I китайские ученые провели большую работу, связанную с отслеживанием происхождения, и исследование было опубликовано своевременно. Серологические тесты доноров крови в Ухане во второй половине 2019 года были опубликованы в журнале Protein and Cell. Исследование вирусных профилей более 17 000 летучих мышей в Китае, опубликованное в журнале National Science Review, не выявило последовательности нового коронавируса или связанных с ним коронавирусов.
GT: Есть ли у вас какие-либо комментарии к недавно опубликованному документу, опубликованному китайским CDC?
Цянь: Нет прямых доказательств, подтверждающих подлинное происхождение COVID-19, и распространение вируса от летучих мышей к другим животным, а затем от животных к людям считается одной из возможных гипотез происхождения, но где именно, когда и как произошел процесс, пока не ясно.
Все образцы животных, собранные на рынке, о которых упоминалось в документе, были отрицательными, и только некоторые образцы окружающей среды дали положительный результат, что, скорее всего, произошло в результате заражения людей COVID. Данные из статьи подтверждают мнение о том, что рынок Хуанань, возможно, был просто усилителем передачи COVID-19, а не местом, где возник COVID-19.
Китайские эксперты очень усердно работали над изучением происхождения COVID-19, что является чрезвычайно сложной задачей. Недавно в нескольких странах также были обнаружены некоторые коронавирусы летучих мышей, имеющие очень высокую гомологию в последовательности генома вируса SARS-CoV-2, что указывает на важность сотрудничества между странами для отслеживания происхождения вируса. В настоящее время точное место зоонозной передачи вируса человеку остается неизвестным и требует дальнейшего изучения.
GT: Некоторые официальные лица в ВОЗ предположили отсутствие прозрачности со стороны китайского правительства в отношении данных, связанных с COVID-19, и утверждали, что это могло повлиять на глобальное происхождение-отслеживание. Каково ваше мнение по этому поводу, и были ли какие-либо трудности с отслеживанием происхождения?
Цянь: Насколько я знаю, данные, упомянутые в документе, на самом деле были в значительной степени включены в совместный отчет ВОЗ и Китая за 2021 год, и соответствующий отчет можно найти в Интернете. Исследователи в Китае очень усердно работают над выяснением происхождения и продолжают тесно сотрудничать со многими международными экспертами.
Но отслеживание происхождения вируса является чрезвычайно сложной задачей. Вспышка ВИЧ началась в 1970-х годах, но ее зоонозное происхождение было выявлено только в 2014 году, а вирус попал в организм людей примерно в 1920 году. Вирус Эбола был обнаружен в 1970-х годах, но до сих пор не совсем ясно, как это началось. Места, где часто происходили вспышки, не были местом происхождения вируса, например, грипп 1918 года, ВИЧ и так далее. Коронавирусы летучих мышей, очень похожие на COVID-19, были обнаружены во многих местах мира, и отслеживание происхождения требует тесного сотрудничества между различными странами и регионами.
GT: В некоторых сообщениях СМИ утверждалось, что совместный доклад ВОЗ и Китая по отслеживанию происхождения COVID-19 вызвал широкую критику из-за отсутствия оригинальных данных о ранних случаях из Китая. Каково ваше мнение по этому поводу?
Цянь: Я заметил статью в Science, в которой упоминаются эти взгляды, но из того, что я узнал, данные были переданы группе ВОЗ в ходе совместного расследования ВОЗ и Китая. Основные выводы совместного доклада ВОЗ и Китая заключаются в том, что лабораторное происхождение пандемии считалось "крайне маловероятным", а переход от летучих мышей к людям от промежуточного вида был "наиболее вероятным". Они в значительной степени считаются консенсусом среди ведущих экспертов в области вирусологии.
Я лично считаю, что результаты этапа I по отслеживанию происхождения, а также профессионализм и международная репутация членов комиссии и ВОЗ заслуживают полного уважения. Отслеживание происхождения вируса является чрезвычайно сложной и профессиональной задачей. Мы надеемся, что эксперты в стране и за рубежом смогут работать вместе, чтобы решить эту проблему как можно скорее.
Global Times Текст статьи с английского языка на русский перевёл Яндекс
Продолжение темы: ГЛОБАЛЬНАЯ АТАКА СВЕРХБОГАТОЙ НЕЛЮДИ ПРОТИВ ЧЕЛОВЕЧЕСТВА НАЧАЛАСЬ В ЕВРАЗИИ ПРАКТИЧЕСКИ ОДНОВРЕМЕННО