Юношей поступил на датскую службу, став в 1831 году ротмистром легких драгун. В том же году от пневмонии умер его отец.
За неделю до своего 27-летия Фридрих женился на принцессе Аделаиде Шаумбург-Липпской, которой исполнилось 20 лет. Свадьба состоялась 16 октября 1841 года в Бюкебурге. Впоследствии у пары родилась дочь:
Августа (1844-1932) - супруга принца Вильгельма Гессен-Филипсталь-Бархфельдского, единственный сын;
В 1848 году супруги развелись. В том году принц принимал участие в Первой войне за Шлезвиг, со своим 2-м драгунским полком присоединившись к повстанцам. Поэтому, в 1849 году, он был вычеркнут из списков личного состава армии.
В 1854 году Фридрих снова женился на своей бывшей супруге. Церемония брака прошла 7 мая 1854 года в Турине. После этого у пары родилось ещё четверо детей:
Фридрих Фердинанд (1855-1934) - герцог Шлезвиг-Гольштейн-Зондербург-Глюксбургский, был женат на Каролине Матильде Аугустенбургской, имел шестеро детей;
Луиза (1858-1936) - супруга князя Вальдек-Пирмонт Георга Виктора, имела с ним единственного сына;
Мария (1855-1941) - настоятельница в Итцехо;
Альбрехт (1863-1948) - был дважды женат, имел пятерых детей от обоих браков.
В 1858 году принц получил новое разрешение на ношение датского мундира.
В 1878 году умер бездетным его брат, Карл! Титул герцога Шлезвиг-Гольштейн-Зондербург-Глюксбургского унаследовал Фридрих. Сам он ушел из жизни 27 ноября 1885 в возрасте 71 года.